محققان ابزاری را ایجاد کرده اند که به مجموعه داده های glycomics اجازه می دهد با استفاده از هوش مصنوعی برای تشخیص زودهنگام سرطان تجزیه و تحلیل شود.

دانشمندان دانشگاه کالیفرنیا ابزاری به نام GlyCompare توسعه داده اند که به محققان امکان می دهد مجموعه داده های گلیکومیک را با استفاده از هوش مصنوعی تجزیه و تحلیل کنند ، که به طور بالقوه منجر به تشخیص زودهنگام سرطان می شود. GlyCompare یک دیدگاه در سطح سیستم دارد که مسیرهای بیوسنتتیک مشترک گلیکان ها را در داخل و بین نمونه ها محاسبه می کند.

به گفته تیم ، یکی از کلیدهای رویکرد GlyCompare این است که مراحل بیولوژیکی مورد نیاز برای سنتز زیر واحدهای تشکیل دهنده گلیکان را مورد بررسی قرار می دهد ، نه اینکه فقط به کل خود گلیکان نگاه کند ، در نتیجه دقت تجزیه و تحلیل آماری را بهبود می بخشد.

داده های glycomics برای معرفی فناوری خود ، تیم توانایی خود را در افزایش مقایسه مجموعه داده های گلیکومیک با تمرکز بر روابط پنهان بین گلیکان ها در زمینه های مختلف ، از جمله بافت های سرطان معده ، نشان داد. آنها با توجه به اهمیت تغییرات گلیکان در سرطان و کاربرد آن برای تشخیص مراحل اولیه از سرطان به عنوان یک مثال مفید استفاده کردند.

در تحلیلی دیگر ، تیم نشان داد که این روش قدرت آماری را به میزان قابل توجهی افزایش می دهد. محققان نشان دادند که GlyCompare برای بدست آوردن قدرت معادل برای تشخیص نشانگرهای زیستی به نصف نمونه نیاز دارد.

محققان معتقدند که این رویکرد تشخیص تغییرات ظریف تر در گلیکوزیلاسیون را در بسیاری از کاربردها ، از جمله سرطان در مراحل اولیه ، امکان پذیر می کند.

علاوه بر این ، GlyCompare می تواند به بینش جدیدی در مورد مکانیسم های تغییرات مشاهده شده در گلیکان منجر شود.

201000620.184